如何讓iTunes中應用程式勾選的項目與目前iPhone中的一樣呢?

[Kunsong]

請問各位先進、高手、達人，
　　平時都用 iTunes 來下載 APP 到 PC，但 iPhone 有開自動下載 APP，
所以 iTunes 中的 APP 裡面有包含了 iPhone 下載過所有的 APP （包含已刪除）。

　　這支 iPhone 買來時一開始有與 PC 同步過一次，但後來都是備份到 iCloud，
APP 的部份 iTunes 勾選的部份已與 iPhone 中不同，
如果現在 iTunes 若勾選應用程式同步，它會變成跟目前 iTunes 中勾選的一樣，
有沒有辦法讓 iTunes 中應用程式勾選的項目與目前 iPhone 中的一樣呢??
不然目前手機安裝近 600 個 APP ，要一個一個核對勾選，會對到眼花　**