iTunes同步APP是相關連您Apple ID的
在iTools裡安裝也是同樣道理（此處排除您用其他不當手法安裝的第三方APP）
以下為小弟個人經驗
1.iTunes的APP基本上都是您個人Apple ID在Store上購買的，所以APP上一定會有您ID的帳號（如下圖iTools既可看到）
2.一般iTunes備份既可把大部分的照片，聯絡人資訊等等給備份，至於您說的遊戲記錄，那就非得用第三方軟體，小弟覺得非必要性
3.另一種情況就是您的iPhone4S裡有的APP如果在電腦iTunes APP資料庫中沒有，那您點擊同步時，iPhone4S上的APP當然會被清空，這是資料數據同步的基本觀念，數據不統一，自然以數據庫為準，所以建議，在進行同步之前，先在設備點擊右鍵，傳送購買項目，將APP傳送到電腦iTunes的APP數據庫中，這只是APP傳送，並不包含您所說的紀錄檔，如下圖
希望這樣的解說您可以大致上了解
但是小弟拙見
非必要性的話
可以不用第三方軟體做安裝同步
因為iTunes非常強大了
您要是能夠學會其中的奧祕
那你也就是無敵大魔王了
